Saito Hiraga ve Louise Françoise Le Blanc de La Vallière, Zero no Tsukaima: Prensesler no Rondo'daki olayların ardından saldırıya geçiyor. Birlikte, "boşluğun" gücünü kontrol eden diğer iki kişinin yardımıyla Kutsal Romalia Şehri'nde Kral Joseph ile karşı karşıya gelirler. Ancak önlerindeki pek çok çatışmanın ortasında, kadim bir kötülük gölgelerde kıpırdamaya başlar. Yakın bağları daha fazlasına mı dönüşecek yoksa üstlenmeleri gereken görevlerin giderek artan zorluğu nedeniyle paramparça mı olacaklar? Zero no Tsukaima F, birlikte son zorluklarla yüzleşen Louise ve Saito'nun hikayesini anlatıyor.