Tokyo'nun eteklerinde bulunan Hachimitsu Özel Akademi, yüksek kaliteli eğitimi ve disiplinli öğrencileriyle ünlü, tamamı kızlardan oluşan prestijli bir yatılı okuldur. Ancak okulun en ikonik politikasının gözden geçirilmesi nedeniyle bu durum değişmek üzere; artık erkek çocuklar da kayıt yaptırabiliyor. Bu yeni kararnameye göre ilk yarıyılın başında yalnızca beş erkek öğrenci kabul edildi ve öğrenci sayısı etkili bir şekilde iki yüz kıza bir erkek öğrenci oranına bölündü. Kiyoshi, Gakuto, Shingo, Andre ve Jo, herhangi bir ilk izlenim yaratma şansı bulamadan hızla bir kenara atılır. Kız öğrenci arkadaşlarıyla iletişim kuramayan hevesli çocuklar, gözlerini çok daha tehlikeli bir göreve diktiler: kızlar tuvaletini gözetlemek! Ancak planlarının kötü şöhretli Yeraltı Öğrenci Konseyi tarafından tamamen yok edilmesinden sonra, karışık mürettebat özgürlüklerinin aniden ellerinden alındığını fark eder ve ceza olarak bir ay hapis cezasıyla okul hapishanesine atılırlar. Böylece, sonunda dostluk bağlarını ve sapkın kardeşliği sınayacak haklı bir mücadele olan, Hapishane Okulu'ndaki çocukların zorlu yaşamlarının hikayesi başlıyor.