Lise üçüncü sınıf öğrencisi Koyomi Araragi, terk edilmiş bir binada yaşayan garip bir adam olan Meme Oshino'nun yardımıyla bir vampir saldırısından kurtulmayı başarır. Vampirizmden kurtarılmış ve artık yeniden bir insan olmasına rağmen, insanüstü iyileştirme yetenekleri ve gelişmiş görüş gibi çeşitli yan etkiler hala devam etmektedir. Ne olursa olsun Araragi, arkadaşı ve sınıf başkanı Tsubasa Hanekawa'nın yardımıyla normal bir öğrencinin hayatını yaşamaya çalışır. Sınıf arkadaşı Hitagi Senjougahara merdivenlerden düşüp Araragi tarafından yakalandığında oğlan, kızın doğal olmayan bir şekilde ağırlıksız olduğunu fark eder. Senjougahara'nın itirazlarına rağmen Araragi, ona yardım etmekte ısrar eder ve bir zamanlar kendi zor durumunda ona yardım eden Oshino'nun yardımını almaya karar verir. Bakemonogatari, iblisleri ve tanrıları içeren çeşitli hikayeler aracılığıyla, doğaüstü hastalıklardan muzdarip olanlara yardım etmeye çalışan Araragi'yi takip ediyor.